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GelRed核酸染料無論用于預制凝膠染色還是凝膠電泳后染色，都表現出了*的靈敏度。為配合 312 nm UV 凝膠成像系統而設計的 GelRed ，在使用了我們新開發的具有的試驗步驟后(該試驗步驟中使用稀釋的 NaCl 溶液替代傳統的 TBE 緩沖溶液)，在凝膠電泳后染色中優于或者至少相當于 SYBR Gold 。但與 SYBR Gold 不同， GelRed核酸染料在預制凝膠中使用時仍然有*的靈敏度，事實上GelRed 在檢測低濃度、微量 DNA 方面比 EB 表現出更高的靈敏度，尤其對小分子量的 DNA 檢測非常靈敏。
GelRed核酸染料可以滿足使用 488 nm 激光凝膠掃描儀或者可見光激發的 Dark Reader 的研究人員的使用要求。 GelGreen 無論是在預制凝膠還是凝膠電泳后染色中都與 SYBR Green I 靈敏度相當，但不存在后者的不穩定性問題。實際上， GelRed核酸染料，特別是 GelRed 非常穩定，可以長期在室溫下保存。當這兩種染料稀釋在 TBE 或者類似的電泳緩沖溶液中時甚至可以使用微波爐加熱，便于采用常規方法制備預制凝膠。含有染料的預制凝膠可以成批制備，長期保存。
同樣重要的是， GelRed核酸染料相比 EB 或 SYBR Green I 提高了安全性。 獨立的測試服務公司( Litron Laboratories, Inc. )進行的標準艾姆斯氏測試結果表明， 在 18.5 μ g /mL (該濃度遠高于推薦用于電泳后染色的 約 4 μ g/mL 的 3X 染色液 )濃度下， GelGreen 沒有誘變性，而 GelRed 也僅在 S9 代謝活化時有微弱的誘變性。 GelRed 和 GelGreen 的特殊化學結構使其難以穿透細胞膜進入細胞，正是這一特性降低了染料的細胞毒性。相反， SYBR Green I 廣泛地用于活細胞線粒體和核 DNA 染色，這正是由于它能快速的被細胞吞入。由于已知 SYBR Green I 對紫外線導致的突變有強烈的增強作用，因此它的高細胞膜透性使它在紫外環境觀察時成為凝膠染色的主要有害物質。
GelRed核酸染料的使用方法
將100ml瓊脂糖凝膠溶液(濃度一般為0.8%~2%)在微波爐中融化。
加入5-10µl GelRed核酸染料(如果背景過高可以適當減少用量，如果敏感度過低，可以適當增加用量)，輕輕搖勻，避免產生氣泡。
冷卻至不燙手時倒膠，待瓊脂糖凝膠*凝固后上樣電泳。
電泳完畢在紫外燈下觀察。若使用數碼相機照像記錄，則關閉相機的閃光燈，放在自動檔即可;若使用凝膠成像系統照相，通過調節光圈、曝光時間，選擇合適的濾光片，可得到成像清晰、背景較低的照片。
GelRed核酸染料使用時的注意事項
1. 膠厚度不宜超過0.5cm，膠太厚會影響檢測的靈敏度。加入GoldenView的瓊脂糖凝膠反復融化可能會對核酸檢測的靈敏度產生一定影響，但不明顯。通過凝膠電泳回收DNA片段時，建議使用GelRed核酸染料染色，在自然光下切割DNA條帶，避免紫外線與EB對目的DNA產生的損傷，可明顯提高克隆、轉化、轉錄等分子生物學下游操作的效率。
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